玉米颗粒结合型淀粉合成酶GBSS基因序列变异及其与籽粒淀粉品质性状的关联分析

【作者】 刘静； 杨泽峰； 徐辰武；

【机构】 扬州大学江苏省作物遗传生物重点实验室/教育部功能基因组学重点实验室；

【摘要】 颗粒结合型淀粉合成酶(GBSS)由Wx基因编码,以结合性颗粒的形式存在,是合成直链淀粉的关键酶。本研究以玉米自交系B73的GBSS基因序列为模版,对83份普通玉米和13份糯玉米玉米自交系的2个GBSS基因进行测序,寻找单核苷酸多态性(SNP)位点与插入/缺失(InDel)事件,将之与淀粉品质性状(直链淀粉含量、淀粉糊化特性和热力学特性)进行关联分析,筛选优异的等位变异。分析结果表明:(1)2个GBSS基因中共发现299个SNP位点与123个InDel事件,不同基因之间变异频率差异变化较大。(2)2个基因的Tajima’s D值均不存在显著差异,表明GBSSⅠ和GBSSⅡa基因进化过程中没有明显偏离预期的中性选择结果。(3)基于候选基因关联分析方法,检测到与淀粉品质性状显著相关的变异位点分布如下:GBSSⅠ基因编码区发现2个SNP位点和2个InDel,GBSSⅡa基因编码区上关联到3个SNP位点。更多还原