小麦D基因组供体种粗山羊草(Ae.tauschii,L)核小体占位与组蛋白修饰

【作者】 孔垂正； 高丽锋； 贾继增； 赵光耀； 刘旭；

【机构】 中国农业科学院作物科学研究所；

【摘要】 染色质DNA通过包装为核小体这一基本单位,进一步缠绕与互作形成高级的三维结构,并行使其功能。核小体包装主要包括核小体占位与核小体重塑。DNA的复制、转录和翻译等都受到核小体包装的调控。核小体包装还是染色质开放结构、基因结构、三维互作结构的基础。此外,核小体组蛋白修饰、组蛋白变体能够在理化性质上影响其上缠绕DNA的裸露程度、甲基化程度以及酶的可接近程度。对于作物基因组核小体的探究,能够进一步加深我们对于基因组功能的理解。我们初步统计小麦D基因组供体种粗山羊草基因组中核小体数目及其分布。共定义到4类核不同类别的核小体,分别对应不同的生物学意义。我们调查了DNA缠绕在核小体上的比例及其分布。结果表明核小体在染色体上不是均匀分布的。在基因编码区的核小体排布密度较高,调控元件区域等转录因子结合位点的位置核小体密度较低,但结合位点两侧核小体占位明显。进一步统计了CACTA、Copia和Gypsy三种转座子(TE)上的核小体分布,结果表明TEDNA的核小体占位整体不如基因上的紧凑。我们还调查了核小体占位和组蛋白H3、组蛋白修饰、DNA甲基化的关系。更多还原