节节麦籽粒性状的全基因组关联分析

【作者】 赵昕鹏； 麻菲菲； 葛一凡； 吕琳琳； 周云； 张大乐； 李锁平； 宋纯鹏；

【机构】 河南大学生命科学学院植物逆境生物学重点实验室；

【摘要】 节节麦(Aegilop tauschi Coss.,DD,2n=14)是普通小麦的二倍体祖先种,从遗传上,节节麦主要分为L1系和L2系,由于只有特定区域分布的少数L2系节节麦参与了普通小麦的起源,因而节节麦的遗传变异类型远比普通小麦D基因组丰富,是改良普通小麦的重要的潜在基因资源。利用小麦55KSNP芯片D基因组上的4282个多态性位点分析221份节节麦自然群体的基因型,结合2个年度、5个环境内的表型数据,进行全基因组关联分析,检测与籽粒长显著相关的位点305个,与籽粒宽显著相关的位点15个,与籽粒周长显著相关的位点349个,与籽粒长宽比显著相关的位点619个,与百粒重显著相关的位点96个。其中,可以在两个及两个以上环境内检测到的显著位点,籽粒长有96个,籽粒宽有2个,籽粒周长有13个,籽粒长宽比有150个,百粒重有2个。此外,还有95个位点同时与籽粒长、籽粒周长、籽粒长宽比中的全部或部分性状显著相关。基于高重复性的位点,成功开发了85个KASP标记,在683份小麦自然群体和322份节节麦T015-周麦18渐渗系群体内进行验证。其中,20个与籽粒长相关的位点,14个与籽粒长宽比相关的位点,5个与籽粒周长相关的位点得到验证。对稳定的显著位点区段内的基因序列进行比对分析,发现有3个候选基因与已知的粒形相关的TGW6、SRS5、MKK4同源性较高或位置相近。更多还原