植物高效群体转录组测序技术研究

【作者】 徐俊； 王静； 杨晓寒； 鲁非；

【Author】 F.L.;

【机构】 中国科学院种子创新研究院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室； 中国科学院大学； 中科院-英国约翰.英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心；

【摘要】 基因表达作为一种中间表型,能够将基因组中的性状控制变异和作物的重要农艺性状关联起来,为阐明遗传机理并应用到作物改良当中提供了新的契机。然而,由于目前基因表达谱检测方法的效率不高,植物转录组学在精准遗传定位的巨大潜力受到了限制。为充分利用植物转录组测序辅助精准遗传定位,我们研发了一种多通路3’RNA-seq建库方法,极大地提高了基因表达谱检测效率。应用该方法,我们对小麦苗期不同组织进行了表达谱检测,结果表明该方法具有成本低、时间短、重复性好以及准确性高的特点。对六倍体小麦的11万个基因进行表达谱检测,只需要500万reads,技术重复的相关系数就可以达到0.95。我们的方法在保证稳定性的同时,实现了高通量低成本的群体转录组信息捕获,为植物遗传解析和育种提供了有力的工具。更多还原