小麦抗赤霉菌侵入基因Fhb5的克隆

【作者】 王鑫； 闫海生； 李国强； 周继阳； 史金星； 曹守阳； 贾海燕； 马正强；

【机构】 南京农业大学应用植物基因组实验室；

【摘要】 Fhb5是本实验室在地方品种望水白中定位到的一个抗赤霉菌侵入的主效QTL。在前期研究中,本实验室利用Fhb5近等基因系衍生的20,000多个F2单株将其精细定位在染色体5AS上相距0.029cM的Xwgrb1356-Xwgrb1619区间。该区间在中国春基因组上对应物理距离约为32.7 Mb,位于近着丝粒的重组冷点区,这使得利用传统图位克隆的方法克隆Fhb5异常艰难。本研究利用基因组重测序对抗病品种望水白和感病品种绵阳99-323、南大2419和PH691中Fhb5区间的序列进行拼装。结合望水白、南大2419和PH691的RNA_Seq数据,在Fhb5区间预测出55个表达基因。结合这些基因的功能注释、序列分析、表达分析和同源基因分析,对Fhb5的候选基因进行了预测。更多还原