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小麦品种川农16有效分蘗数位点QPtn.sau-4B的鉴定和精细定位
【作者】 刘家君; 罗伟; 秦娜娜; 刘亚西; 魏育明; 兰秀锦; 郑有良; 马建;
【机构】 四川农业大学小麦研究所;
【摘要】 有效分蘖数是小麦产量的主要影响因素,是目前育种的重要目标性状之一。前期我们基于小麦55K SNP芯片,利用小麦品系20828和川农16杂交构建的F7重组自交系群体检测到一个主效的有效分蘖数位点QPtn.sau-4B。该QTL的增效位点来源于川农16,能解释17.23-45.46%的表型变异。在具有不同遗传背景的群体中验证QPtn.sau-4B的遗传效应时发现,该位点能显著增加植株2.68-3.99个分蘖。结合BSA和660KSNP芯片技术,将有效分蘖数位点关联于染色体4B的28Mbp-39Mbp区间内,与我们之前的定位结果基本一致。利用该位点区间内SNP,开发得到与该位点紧密连锁的KASP标记10个,其中KASPAX-110436964距目标位点最近,仅2.1cM。另外,我们在进行遗传学定位的同时,也利用反向遗传学来进行候选基因预测。我们对该位点区间内的18个基因进行功能注释发现,发现基因TraesCS4B01G042700在玉米中的同源基因能编码转录因子TEOSINTE BRANCHED1(TB1),并且TB1在玉米中被广泛报道,其作用是影响玉米分枝和分蘖。结合近期报道以及对该基因的同源基因和启动子序列分析发现,TB1并非QPtn.sau-4B的候选基因。因此,我们正在创制近等基因系以进一步精细定位来获得该位点的候选基因。本研究将为后续QPtn.sau-4B精细定位、克隆以及其候选基因功能验证奠定基础。
- 【会议录名称】 第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集
- 【会议名称】第十届全国小麦基因组学及分子育种大会
- 【会议时间】2019-08-11
- 【会议地点】中国山东烟台
- 【分类号】S512.1
- 【主办单位】中国作物学会