水稻自然变异群体淹水发芽相关特性鉴定和全基因组关联定位研究

【作者】 陈振挺； 冯芳君； 严明； 范佩清； 马孝松； 吴金红； 梅捍卫；

【机构】 上海海洋大学水产与生命学院； 上海市农业生物基因中心； 农业农村部作物基因资源与种质创制上海科学观测实验站；

【摘要】 筛选芽期耐淹水的水稻种质资源,用于改良现有的水稻品种的淹水发芽特性,是保障水稻水田直播后快速、整齐出苗的有效方法之一。利用30份水稻品种资源,观测淹水萌发过程中胚芽鞘长度的动态变化情况,确定水稻淹水发芽相关性状的表型鉴定方法。利用一套包含268个品种的水稻自然变异群体,分别在淹水和正常条件下开展发芽试验,以发芽率和幼苗胚芽鞘长度为主要鉴定指标,结果表明该群体中大部分品种不具备淹水发芽能力,胚芽鞘较对照条件下延长程度的变异系数达到22.4%,存在较为丰富的遗传变异;籼稻和粳稻品种间存在萌发耐淹性的显著差异,粳稻品种具有较强的淹水萌发能力。筛选获得黄壳早廿、隆化毛葫、铁杆乌、抚宁紫皮、BINIRHEN、葡萄黄、DJAUB、CICA 4等8个品种在淹水条件下具有较高发芽率和胚芽鞘延长能力。利用该套群体已有的3,038,555个SNP标记的基因型数据和全基因组关联定位分析软件包GAPIT,初步在水稻第1、2、7、9、11、12号染色体上定位到7个显著关联位点,后续候选基因的预测和表达特性分析正在进行之中。更多还原