黄绿卷毛菇环境适应相关基因的分析研究

【作者】 谢占玲； 郭璟； 孟清；

【机构】 青海大学；

【摘要】 为探索黄绿卷毛菇环境适应机制,对转录组数据库中与环境适应相关的基因进行分析研究,结论如下:(1)筛选出45条与环境适应相关的基因;按照基因功能可分为3类:传递环境信号类基因(13条,28.89%),生化反应准备类基因(12条,26.67%),效应类基因(20条,44.44%);其中传递环境信号类的基因可进一步分为钙离子信号转导相关基因(6条,13.33%)和G蛋白信号转导相关基因(7条,15.56%);生化反应准备类基因主要为激酶基因;效应类基因可进一步分为转录翻译类基因(5条,11.11%),泛素相关类基因(5条,11.11%),抗逆境类基因(6条,13.33%)和其他代谢物质类基因(4条,8.89%);(2)对全部45条基因进行表达量统计,并利用DESeq软件筛选出差异表达基因共12条,其中上调基因和下调基因分别为0条和12条;(3)运用qRT-PCR对热休克蛋白(c3609_g1)和谷氨酰胺合成酶(c5873_g1)进行验证,经计算热休克蛋白(c3609_g1)差异倍数为0.03为下调基因,谷氨酰胺合成酶(c5873_g1)差异倍数为1.03为共表达基因,与转录组分析结果一致;(4)对热休克蛋白(c3609_g1)和谷氨酰胺合成酶(c5873_g1)进行生物信息学分析,发现其功能与其氨基酸序列信息和二、三级结构密切相关。(5)提出了黄绿卷毛菇应对环境胁迫的模式。更多还原