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一种新极化力场的发展与测试
【机构】 辽宁师范大学化学化工学院；
【摘要】 现如今,虽然已有多种流行分子力场可以针对多肽的结构和能量进行广泛地预测,但是其预测精度却一直有待于提高[1]。最近,一种新的基于键偶极相互作用的极化力场被提出。基于我们之前发表的工作以及AMBER99SB力场的参数[2],我们选取大量的甘氨酸和丙氨酸二肽分子构象作为模型分子,与QM (Quantum Mechanics)方法计算得到的结果作为标准数据进行对比,进而重新拟合二面角参数,最后将获得的新参数应用于更大更多的体系能量和结构模拟预测上。研究表明,与QM方法计算结果进行比较,使用新发展的极化力场预测甘氨酸和丙氨酸相对能量的均方根偏差约为1.0kcal/mol左右;预测甘氨酸和丙氨酸结构的均方根偏差均在0.5?以下,且所有计算结果精度远远高于其他分子力场。
- 【会议录名称】 第十三届全国量子化学会议论文集——第三分会：量子、经典和统计反应动力学
- 【会议名称】第十三届全国量子化学会议
- 【会议时间】2017-06-08
- 【会议地点】中国辽宁大连
- 【分类号】O641.1
- 【主办单位】中国化学会