发展ABEEMσπ方法计算含硼蛋白体系的电荷分布

【作者】 卢丽男； 杨忠志；

【机构】 辽宁师范大学化学化工学院；

【摘要】 本文发展ABEEMσπ方法首次计算含硼蛋白电荷分布,从蛋白质晶体数据库(PDB)中截取得到26个含B蛋白模型分子,对模型分子的处理采用成键模型[1-4]。拟合得到新增加的含硼蛋白的相关模型参数即参考电荷,价态电负性和价态硬度。ABEEMσπ方法计算得到的电荷分布的结果,和QM方法计算的电荷结果的线性相关系数R均在0.97以上,斜率接近于1.00,截距接近于0.00。重点考察了模型分子的偶极矩,得到了与QM方法相近的结果。把拟合得到的ABEEMσπ方法的参数转移到其他含硼蛋白的含几百个原子的大分子模型,均得到了很好的电荷分布结果,证明了我们新得到的ABEEMσπ方法的电荷参数的正确性、可靠性和可转移性。本文的研究成果扩大了ABEEMσπ方法的应用范围,为研究含硼蛋白大分子体系提供了一个新的可靠的方法。更多还原