基因芯片筛选甲苯二异氰酸酯（TDI）哮喘小鼠差异表达基因

【作者】 黄敏於； 赵文驱； 彭显如； 李博厚； 袁亚飞； 蔡绍曦； 赵海金；

【机构】 南方医科大学南方医院呼吸与危重症医学科慢性气道疾病实验室；

【摘要】 目的 :甲苯二异氰酸酯(TDI)哮喘为中性粒细胞炎症为主的混合粒细胞哮喘,是哮喘研究中非常重要的研究模型,其发病机制涉及免疫、炎症等多种机制。本研究旨在应用全基因表达谱芯片探讨TDI哮喘小鼠模型差异表达基因,进一步分析可能的通路及靶点。方法:用TDI致敏激发小鼠建立哮喘模型,20只雄性BALB/C小鼠随机分为2组,每组10只。肺组织HE染色等鉴定模型制备成功。取其中代表性样本进行基因芯片检测,芯片数据经质量控制检查,聚类分析等获取差异表达基因,再通过趋势聚类分析、LncRNA靶基因预测、IPA(Ingenuity Pathway Analysis)在线整合分析软件等方法探讨其相应功能和通路,再经定量PCR验证目标基因。结果:按P<0.05差异显著性标准,共筛选出TDI哮喘小鼠与正常对照差异表达1.5倍以上的基因,包括上调589个,下调398个。经代谢途径分析发现这些差异基因主要涉及哺乳动物生物节律调控、细胞因子受体相互作用、IgA分泌免疫调节、细胞间连接、胞外基质受体相互作用、凋亡通路等免疫炎症信号。结论:芯片技术可有效地筛选出TDI哮喘小鼠与正常对照的差异表达基因,对进一步探索哮喘的发病机制、干预或逆转哮喘具有重要意义。更多还原