彗星自动化分析软件Opencomet的应用研究

【作者】 马小菊； 张雪； 梁博萱； 刘学星； 彭靖； 郭虹雨； 邓娜； 张钊瑞； 廖其龙； 邓棋霏； 肖勇梅；

【机构】 中山大学公共卫生学院； 广东省职业病防治院；

【摘要】 目的为了提高彗星测量的自动化和标准化,本文通过比较使用Opencomet与CASP lab分别对相同彗星图像的测量结果,探讨Opencomet在彗星图像测量和分析中的实际应用价值。方法使用图片处理软件ImageJ的插件Opencomet进行彗星测量。由一名具有测量经验的实验人员分别使用Opencomet和CASP lab对40例苯中毒患者的彗星图像进行测量,每例样本随机选取其中100个细胞进行测量并分别计算尾部DNA含量百分比(TailDNA%)、尾距(TailMoment)、Olive尾距(Olive Tail Moment)的均数和中位数。使用Spearman法分析两组结果的相关性,wilcoxon符号秩检验比较两组结果的差异。此外,为了探讨Opencomet测量结果稳定性和可重复性,3名操作人员分别使用Opencomet对随机选取的10例样本的彗星图像进行测量,并对结果进行统计分析。结果 Opencomet具有自动识别、分析、储存和结果可溯源的优点,与CASP lab相比,分析同样的彗星图像花费时间大大减少。两种方法测得各样本的均值结果存在正秩相关关系,其中TailDNA%的秩相关系数r_s=0.597(P<0.0001);Tail Moment的秩相关系数r_s=0.574(P<0.0001);Olive Tail Moment的秩相关系数r_s=O.612(P<0.0001)。说明两者有较好的一致性。Opencomet与CASP lab的测量结果相比较,Opencomet测量得到的TailDNA%、Tail Moment和OliveTail Moment结果均较高,并且差异有统计学意义(P<0.05)。3名操作人员使用Opencomet对其中10例样本的彗星图像进行独立测量。结果显示,三组结果未见显著性差异,且结果高度相关,其中操作员A、操作员B与操作员C的秩相关系数分别为0.964和0.976(P<0.0001)。结论与CASP lab相比,Opencomet具有可自动化测量且可在短时间内分析大量彗星图像的优势,所得结果稳定、可重复性高。Opencomet测量彗星图像的结果数值高于CASP lab测量数值,但对划分同一人群的遗传损伤水平等级的作用接近。该软件更适合应用于大批量彗星图像的测量与分析工作中。更多还原