SNP芯片联合飞行时间质谱筛检胃癌差异miRNA自身SNPs的病例对照研究

【作者】 吴传城； 韩仁杰； 刘宝英； 蔡元华；

【机构】 福建医科大学公共卫生学院； 莆田市仙游县医院；

【摘要】 目的本研究旨在探索与胃癌发生相关的新的miRNA自身单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphisms,SNPs),为寻找有价值的胃癌分子标志物提供新的依据。方法本研究采用1:1配对病例对照研究的方法。应用SNP芯片对福建省胃癌高发区96例胃腺癌患者与96例健康对照人群基因组中miRNA自身SNPs位点进行检测,应用飞行时间质谱分析质谱技术对芯片筛检出来的miRNA自身SNPs位点在622例胃癌患者和622例正常健康基因组中进行验证。结果(1)SNP芯片及生物信息学分析选取miR-379 rs7143252,miR-519b rs10413288,miR-1297 rs9536676,miR-29c rs2724377,miR-7159 rs4713714为候选基因研究。(2)对大样本的病例对照组候选基因SNP分型,rs7143252中含有G等位基因的基因型(CG+GG)患胃癌的风险高于CC基因型OR 1.92,95%CI1.18～3.12,而其他位点则与患胃癌的风险无统计学意义。分层分析结果发现rs7143252 CG基因型与贲门癌相关OR 2.11,95%CI 1.01～4.40,含有G等位基因的基因型(CG+GG)患非贲门癌风险高于CC基因型OR 2.13,95%CI 1.08～4.19,rs10413288中含有G等位基因的基因型(AG+GG)患贲门癌的风险低于AA基因型OR 0.58,95%CI 0.36～0.94。结论 rs7143252,rsl0413288位点可能是胃癌患者的特异性生物标志物,与福建省胃癌高发区仙游县的胃癌发生发展有关。更多还原