黄瓜重要农艺性状相关基因位点的定位和分子标记开发

【作者】 魏爱民； 杜胜利； 王惠哲； 黄洪宇； 付薪蒙； 候佳利； 韩毅科； 刘楠； 王宁宁；

【机构】 天津科润农业科技股份有限公司黄瓜研究所； 南开大学生命科学学院；

【摘要】 本研究针对黄瓜高产、优质、抗病、抗逆和养分高效利用等重要农艺性状,通过全基因组关联分析方法进行基因定位和分子标记开发。用300份具有不同类型的的黄瓜自交系/商品种进行表型性状分析和基因组重测序,建立用于分子设计育种的优异育种群体表型组和基因组数据库,通过全基因组关联分析等方法鉴定关键基因位点,阐明优良种质资源中携带的优异等位变异,开发新型功能标记。目前已完成黄瓜白粉病抗性、果实商品性、耐低温性、株型性状等26个表型性状调查,并进行表型数据分析;完成300份种质资源材料基因组重测序;同时完成了群体进化树分析、主成分分析、群体遗传结构等遗传多样性分析。(1)黄瓜耐低温性相关基因位点的定位和分子标记开发通过对低温下叶片数、叶面积、株高,及冬季自然低温条件与春季正常温度条件下叶片数、单株叶面积与株高等指标的相对比值,进行全基因组关联分析,获得与耐低温性显著相关的SNP位点24个,分别位于第1-7号染色体上。(2)黄瓜株型相关性状基因位点的定位和分子开发通过对各节位叶长、叶柄长、节间长、叶倾角的平均值、以及功能节位株型性状的平均值进行关联分析,分别获得:第6节和第7节的叶片长度相关的SNP位点23个和2个,位于Chr3上;11-15节叶柄长度相关的SNP位点7个,位于Chr2上;3-21节节间长度相关的SNP位点7个,位于Chr6上。共检测到与黄瓜株型性状显著相关的SNP位点37个。更多还原