中华大蟾蜍多组织差异转录组分析

【作者】 唐瑞祥； 兰月； 王磊； 范振鑫； 岳碧松；

【机构】 濒危动物繁殖与保护四川省重点实验室四川大学生命科学学院； 生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院；

【摘要】 中华大蟾蜍(Bufo gargarizans)的皮肤产物蟾酥以及其褪皮而得的蟾衣具有极高的药用价值,现代医学的研究证明了蟾酥和蟾衣内含有多种有效的生物活性成分。蟾酥主要由蟾蜍耳后腺组织分泌,耳后腺作为皮肤组织的主要分泌部位。为了研究蟾蜍不同组织的基因表达以及探索调控蟾酥分泌的基因表达网络,本研究对一只蟾蜍的肝脏、脾脏、心脏、卵泡、肌肉、腹部皮肤、右耳后腺共7个组织使用RNA-seq进行了转录组测序,使用De Novo的方式完成了中华大蟾蜍转录组的组装,产生了270,017条转录本序列,得到一个较为完整的中华大蟾蜍转录组。功能注释在NR,Swiss-Prot,KEGG,COG和GO这5个公共数据库中共注释到44,976(34.04%),34,984(26.47%),11,896(9.00%),11,292(8.54%)和12,320(9.32%)条转录本,整理后共计注释到47,156 (35.69%)条转录本。基于表达量比较分析,鉴定出在耳后腺组织与其他组织间共计4,092个显著上调基因和246个显著下调基因,这些差异表达基因显著富集在了蛋白质合成、酶的调节、前体物质的代谢合成等通路上,比如鞘糖脂的生物合成通路、核糖体相关通路。其中甾类激素生物合成通路中的HSD11B2、cytochrome P450家族等基因,可能对蟾蜍甾族化合物的合成起到关键作用。更多还原