林麝脓肿病相关miRNA的鉴定及其与靶基因互作分析

【作者】 戚文华； 竭航； 赵贵军； 严超超； 岳碧松；

【机构】 重庆三峡学院生物与食品工程学院； 重庆市药物种植研究所； 四川大学生命科学学院；

【摘要】 MicroRNA(miRNA)是一类长度大约18-25 nt的非编码单链RNA序列,可以调控靶基因的翻译,随后利用基因转录机制控制蛋白编码。目前已证实miRNA在生物体生长、发育和疾病发生等过程中发挥着重要的作用。动物miRNA基因在进化上具有高度的保守性,许多序列都可以在亲缘关系相近的物种中找到,甚至在亲缘关系较远的物种中都有发现。本药研究通过高通量测序对30只幼体、亚成体和成体雌雄林麝(健康组和脓肿病组)的血液进行small RNA测序,利用成熟miRNA序列的保守性以及前体结构具有发夹二级结构的特性在不同年龄段健康和脓肿病林麝中共鉴定出874个miRNA分子,其中已知miRNA有469个,新的未知miRNA有405个。所有miRNA前体序列长度为60-120bp,平均长度为80bp。序列分析发现林麝血液miRNA表达谱中874个序列形成198个基因家族,而最少的家族miR-3957有4个成员,而大多数miRNA家族有30个成员以上。目前预测获得120个与林麝免疫疾病相关的miRNA,并进行了miRNA与其靶基因互作分析;初步预测了获得12个与林麝泌香相关miRNA,并且进行了靶基因分析。通过二级结构分析表明,绝大多数序列能够形成典型的发夹结构。目前通过RT PCR实验验证10个候选miRNA前体在血组织中的表达情况。更多还原