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基于重测序的栽培种花生的全基因组变异挖掘
【作者】 熊发前； 刘俊仙； 刘菁； 贺梁琼； 蒋菁； 唐秀梅； 黄志鹏； 吴海宁； 钟瑞春； 韩柱强； 唐荣华；
【机构】 广西农业科学院经济作物研究所；
【摘要】 为全面揭示和挖掘栽培种花生的全基因组变异,本研究对两个栽培种花生品种"桂花32"和"桂花836"进行高通量重测序。结果表明,两个品种的测序深度分别为27×和26×,分别获得了64.6Gb和65.1Gb的测序数据,分别获得了6 556 990个(其中纯合4 374 199个,杂合2 182 791个,转换4 826 057个,颠换1 730 933个)和6 541 579个(其中纯合4 346 326个,杂合2 195 253个,转换480 991个,颠换1 731 668个)SNP,分别获得了1 199 757个和1 194 570个InDel,分别获得了148 899个(其中,缺失32 358个和插入256个)和145 175个SV(其中,缺失34 439个和插入513个),尤其SV结构变异的挖掘为下一步高效简单实用SV分子标记的开发奠定基础,本研究为下一步花生重要性状的QTL精细定位及分子标记辅助育种提供了丰富的分子标记资源。
- 【会议录名称】 中国作物学会油料作物专业委员会第八次会员代表大会暨学术年会综述与摘要集
- 【会议名称】中国作物学会油料作物专业委员会第八次会员代表大会暨学术年会
- 【会议时间】2018-11-19
- 【会议地点】中国山东青岛
- 【分类号】S565.2
- 【主办单位】中国作物学会油料作物专业委员会、《中国油料作物学报》编辑部