GBS-seq技术揭示栽培种花生起源和花生属种间亲缘关系

【作者】 熊发前； 刘俊仙； 刘菁； 贺梁琼； 蒋菁； 唐秀梅； 黄志鹏； 吴海宁； 钟瑞春； 韩柱强； 唐荣华；

【机构】 广西农业科学院经济作物研究所；

【摘要】 厘清花生属种间亲缘关系和栽培种花生起源有助于将花生野生种优良基因转移到栽培种花生中。以往研究花生属种间亲缘关系和栽培种花生起源多采用常规分子标记技术,且所用分子标记数量比较少,结论精准性有待提高。而本研究首次对花生属41份野生种和栽培种进行了高通量GBS简化基因组测序,SAMTOOLS软件检测共获得了1 579 688个SNP位点,经过条件为dp2、Miss0.4、MAF0的过滤后,最后共获得了61 630个高质量的SNP位点并用来揭示花生属不同区组野生种和栽培种的系统进化关系,结果显示:1)A.ipaensis(19455)和A.duranensis(P1262133)跟栽培种花生品种聚为一类,表明这两个种是栽培种花生的二倍体祖先野生种;2)大部分花生区组野生种与栽培种花生聚在一起,表明它们之间的亲缘关系较近;3)直立区组、异形花区组野生种与大部分花生区组野生种聚为一类,表明它们之间的亲缘关系较近。本研究采用高通量SNP标记阐明花生属种间亲缘关系并明确了栽培种花生的起源,对花生远缘杂交育种具有非常重要的意义。更多还原