甘蓝型油菜PEBP基因家族的鉴定与表达分析

【作者】 荐红举； 杨博； 李阳阳； 杨鸿； 刘列钊； 徐新福； 李加纳；

【机构】 西南大学农学与生物科技学院油菜工程研究中心西南大学现代农业科学研究院；

【摘要】 开花是植物通过有性生殖传递后代的关键前提,而开花时间对作物产量具有直接影响,通过控制开花时间可有效提高作物在不同地域的产量。目前,有关开花候选基因的解析主要集中在拟南芥等模式植物中。植物磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidylethanolamine-binding protein,PEBP)基因对于控制开花时间具有重要作用。油菜作为世界上最重要的油料作物之一,与模式植物拟南芥具有相似的开花习性。但有关油菜开花基因的功能研究相对较少。本研究利用拟南芥PEBP基因家族蛋白序列在油菜基因组内进行BlastP分析,获得油菜PEBP家族成员,并对家族成员进行基因结构分析、motif预测、复制事件、进化树构建、选择压力分析和组织表达分析。实验结果表明,共有26个油菜PEBP基因成员得到鉴定,大部分成员含有4个外显子和3个内含子,motif-1和-2是PEBP成员的特征基序,超过76.9%的成员属于片段复制扩增事件。进化树分析显示,PEBP分为3个亚家族,基于转录组测序的组织表达数据表明油菜26个PEBP成员具有非常明显的组织表达特性。以上研究结果,极大丰富了我们对甘蓝型油菜开花基因及调控模式的认识,为进一步的分子育种提供理论基础。更多还原