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基于GWAS和eQTL挖掘油菜含油量相关的转录因子及其调控网络
【机构】 华中农业大学；
【摘要】 甘蓝型油菜(Brassica napus,AACC,2n=38,以下简称油菜)是我国重要的油料作物,系统研究油菜种子发育过程中的脂质代谢相关基因的表达调控及其与表型之间的联系,对于揭示菜籽油分形成和积累的调控关系非常关键。为了挖掘甘蓝型油菜含油量相关的转录因子(TF),揭示油脂合成相关基因的转录调控机制,我们通过对505份油菜种子含油量进行GWAS分析,鉴定出了380个与含油量显著相关的SNP。同时我们利用上述群体中309份材料的基因表达数据和基因型数据,鉴定出107个eQTL热点区域,并发现eQTL热点中TF显著富集,表明eQTL热点中可能存在与脂肪酸代谢相关的TF。通过整合油菜GWAS和eQTL数据和拟南芥脂类代谢网络等多组学信息,本研究鉴定了甘蓝型油菜种子含油量相关的转录因子并构建其调控网络。其中16个转录因子同时存在与含油量性状和脂类代谢基因显著关联的SNP位点,并且大部分转录因子都具有一因多效(调控多个含油量相关基因)。
- 【会议录名称】 中国作物学会油料作物专业委员会第八次会员代表大会暨学术年会综述与摘要集
- 【会议名称】中国作物学会油料作物专业委员会第八次会员代表大会暨学术年会
- 【会议时间】2018-11-19
- 【会议地点】中国山东青岛
- 【分类号】S565.4
- 【主办单位】中国作物学会油料作物专业委员会、《中国油料作物学报》编辑部