基于SLAF_seq的重组自交系群体定位水稻株高QTL

【作者】 姜雪； 龙武华； 彭强； 张志斌； 张大双； 张习春； 张玉珊； 朱速松；

【机构】 贵州省农业科学院水稻研究所； 贵州师范大学生命科学学院； 贵州省农业科学院生物技术研究所；

【摘要】 【研究背景】株高是水稻一个重要的农艺性状,与品种抗倒伏、抗病虫害、光合强度和丰产潜能等因素密切相关。因此,深入挖掘、分离、鉴定不同材料中控制水稻株高的基因(QTL),并将其应用到水稻育种实践中,具有十分重要的意义。水稻株高性状遗传一般认为是属于质量-数量性状遗传。【材料与方法】本研究利用矮杆品种V20B和高杆品种CPSLO17作为亲本,构建了150个重组自交系家系(RILs),结合SLAF_seq技术构建的水稻高密度遗传图谱,利用MapQTL5进行区间作图方法,阈值设定为2.5,对水稻株高进行QTL效应检测。【结果与分析】检测结果显示在第1和第2染色体各检测到2个株高QTL位点,分别命名为qPH1-1、qpH1-2、qPH6-1和qPH6-2,这4个QTL位点的LOD值分别为3.2、10.4、3.1和5.6,对表型变异的解释率分别为6.5%、22.2%、6.0%和11.6%。其中,qPH1-1、qPH1-2和qPH6-2增效位点来自于CPSLO17,而qPH6-1增效位点来自于V20B。位于第1染色体的qPH1-2的表型贡献率最高,属于主效基因,该位点是否和绿色革命基因(sd1)为同一位点还需进一步精细定位或测序验证。【结论】株高是水稻最重要的农艺性状之一,对水稻高产稳产起着重要作用。目前还没有报道以V20B和CPSLO17为材料对株高基因的研究,本研究用SLAF标签构建的高密度遗传连锁图谱结合表型数据定位这4个材料控制株高的QTLs,将有助于人们进一步了解株高的遗传和调控机制。更多还原