节点文献
基于甜菜全基因组ARF转录因子分析
【机构】 哈尔滨工业大学；
【摘要】 生长素响应因子(auxin response factor,ARF)基因家族是植物中的转录因子,在植物的生长发育方面起到了重要的调控作用。但是并未见文献报道基于甜菜全基因组ARF转录因子的分析,为了能更深入地探讨甜菜ARF基因的功能,以公布的甜菜基因组数据为基础,利用生物信息学的方法鉴定了甜菜ARF基因,并对其基本理化性质、染色体分布、基因结构、蛋白质保守结构域、系统进化树、模体分析和亚细胞定位进行了分析。结果表明,在甜菜中一共鉴定出了14个ARF基因,能编码16个ARF蛋白;除3号染色体之外,在其它8条染色体上都有分布;甜菜ARF蛋白都有B3结构域和AUXIN RESP结构域,但只有11个甜菜ARF有AUX/IAA结构域;几乎所有的ARF蛋白都被定位到了细胞核中。本文为进一步研究甜菜ARF的功能特性奠定了基础。
【基金】 国家自然基金面上项目(合同号31571731)资助
- 【会议录名称】 中国作物学会甜菜专业委员会学术会议论文集
- 【会议名称】中国作物学会甜菜专业委员会学术会议
- 【会议时间】2018-05-16
- 【会议地点】中国黑龙江哈尔滨
- 【分类号】S566.3
- 【主办单位】中国作物学会甜菜专业委员会