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中间锦鸡儿CiMYB60基因克隆及表达分析
【机构】 内蒙古农业大学生命科学学院；
【摘要】 R2R3-MYB转录因子在初生与次生代谢、生长发育及对生物与非生物胁迫的应答等各个方面具有重要作用。本研究以中间锦鸡儿为实验材料利用PCR技术分别以cDNA与gDNA为模板对CiMYB60基因进行了克隆。测序结果表明:CiMYB60基因的开放阅读框为1035 bp,编码345个氨基酸,其基因组DNA序列长度为1485 bp,含有2个内含子和3个外显子。生物信息学分析显示:CiMYB60所编码蛋白的N端包含2个MYB结构域,因此认为其属于典型的R2R3-MYB类蛋白。预测该蛋白分子量为38.41 kDa,等电点为5.95,蛋白整体上是亲水性的。利用染色体步移技术克隆到CiMYB60基因的ATG上游序列长度为1848 bp,分析显示启动子序列中包含一些与光反应、组织特异性表达、激素和非生物胁迫相关的响应元件。利用实时荧光定量PCR技术对CiMYB60基因的表达进行分析,发现在脱水、NaCl和UV-B处理下其表达量随胁迫处理时间的延长而降低。上述研究结果表明CiMYB60基因可能参与中间锦鸡儿对逆境胁迫的响应过程。
- 【会议录名称】 “农业健康与环境”组学大数据整合生物信息学研讨会论文集
- 【会议名称】“农业健康与环境”组学大数据整合生物信息学研讨会
- 【会议时间】2017-08-04
- 【会议地点】中国内蒙古通辽
- 【分类号】S793.3
- 【主办单位】内蒙古民族大学、浙江省生物信息学学会