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柠条锦鸡儿SHN基因的克隆及序列分析
【机构】 内蒙古农业大学生命科学学院；
【摘要】 AP2/ERFs是一个庞大的转录因子家族,对植物的生长发育过程中起着重要作用。根据已报道的蜡质合成相关的转录因子SHN基因序列设计引物,并利用RACE技术克隆获得柠条锦鸡儿的AP2转录因子编码基因SHN的全长cDNA序列。序列比对分析表明,SHN序列长度为999 bp,具有开放阅读框651bp,编码216个氨基酸。预测该基因编码的蛋白分子量为24.06KDa,等电点5.62。氨基酸序列分析显示该序列具有AP2结构域,属于AP2超家族成员。系统进化分析表明该蛋白与大豆SHN3具有最高的同源性,将该基因命名为CkSHN。
- 【会议录名称】 “农业健康与环境”组学大数据整合生物信息学研讨会论文集
- 【会议名称】“农业健康与环境”组学大数据整合生物信息学研讨会
- 【会议时间】2017-08-04
- 【会议地点】中国内蒙古通辽
- 【分类号】S793.3
- 【主办单位】内蒙古民族大学、浙江省生物信息学学会