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竞争模式质谱法区分小分子与G-四链体的结合位点

Distinguish binding sites of G-quadruplexes with ligands in competitive mode by mass spectrometry

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【作者】 周江袁谷

【Author】 Jiang Zhou;Gu Yuan;College of chemistry and molecular engineering, Peking University;

【机构】 北京大学化学与分子工程学院

【摘要】 富鸟嘌呤序列可形成各种G-四链体结构,这些特殊二级结构的形成和性质在许多重要的生命过程中起非常重要的作用。本课题建立了一套竞争模式的质谱方法来区分不同小分子与G-四链体的结合模式或位点。为了直观地比较结合的强弱关系,将四链体DNA与等浓度的2-3个小分子混合,进行竞争模式的实验,在一张谱图上直观的比较不同小分子的结合峰,得到结合强弱顺序。首次观察到了一个四链体同时结合两个不同小分子的峰。通过比较结合不同分子峰[Q1+A+B]与结合峰[Q1+B]的强度,总结出一个可以判断A与B分子之间是否是存在竞争或位点阻碍关系的规律。多级质谱结果也验证了结合位点的不同,建立的一种新型的判断结合位置的有效方法。基于质谱技术研究G-四链体与小分子的结合,为建立高效率筛选特定的癌基因抑制剂、研究G-四链体的生物学功能做出了可行的设计,这也将对人类肿瘤疾病的早期检测和诊断做出相应的贡献。

【Abstract】 In this paper,a competitive model of mass spectrometry was established to distinguish the binding sites of G-quadruplexes with different small molecules.The intensities of binding peaks with G-quadruplex were directly compared to evaluate the binding affinities of small ligands in competition experiments.It was observed that a G-quadruplex binding with two different small molecules.By comparing the intensity of[Q1+B]with[Q1+A+B],whether ligand A and B are in competition can be determined.This study established a new method to quickly determine binding mode of G-quadruplexes.

  • 【会议录名称】 中国化学会第30届学术年会摘要集-第四十三分会:质谱分析
  • 【会议名称】中国化学会第30届学术年会-第四十三分会:质谱分析
  • 【会议时间】2016-07-01
  • 【会议地点】中国辽宁大连
  • 【分类号】R73-3;O657.63
  • 【主办单位】中国化学会
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