P-糖蛋白的结构及功能研究

【作者】 李喆；

【机构】 吉林大学生命科学学院；

【摘要】 P-糖蛋白是一种分子量为170KD的跨膜糖蛋白,具有能量依赖性"药泵"功能。人P-糖蛋白的过量表达是使人类癌细胞产生多药耐药性的主要原因,P-gp通过构象转换将细胞内的抗癌药物转运到胞外,从而使化疗失败。因此研究P-gp的构象转换具有重要学术意义和应用价值。但P-糖蛋白的转运底物机制尚未明了,晶体结构中缺失57个残基的flexible linker结构灵活多变不确定,可能对P-gp的功能具有重要作用。目前,在对P-gp的分子模拟研究中,很少有人研究flexible linker的作用。我们首先将P-gp晶体结构中缺失的flexible linker用Modeller补全,建立膜蛋白质复合体系,用NAMD进行分子动力学模拟,获得蛋白轨迹。然后,运用PCA方法依据蛋白主链二面角对轨迹结构进行分组分析,获得较为合理的优化构象。以优化构象为起点,继续进行分子动力学模拟,获得多条平行的蛋白轨迹,用于后期的研究分析,以期解析P-gp构象转换的作用机理,以及缺失部分对蛋白功能的影响。更多还原