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雌蚕生殖腺五龄1d与蛹期1d miRNA和piRNA的差异研究
【机构】 华南农业大学动物科学学院；
【摘要】 本研究以家蚕品种引6的雌蚕生殖腺为实验材料,旨在了解雌蚕生殖腺在五龄至蛹期的生理生化变化以探索其发育调控的机制,构建了雌蚕生殖腺五龄1d和蛹期1d的sRNA文库,并对sRNA序列进行了生物信息学的分析。经对mi RBase分析,有564个是已知的miRNA,预测了78个属新miRNA;经对它们的差异表达分析,得到171具有显著差异的miRNA;从piRNABank中分析出45个已知piRNA,并对未注释的序列进行了piRNA数量和表达量的预测;对piRNA进行了差异表达分析,得到14个差异显著的piRNA。通过对miRNA和piRNA的靶基因进行GO和KEGG分析,得出在生物过程中,参与细胞进程和代谢过程的靶基因最多,在细胞组分中,位于细胞中的靶基因最多,在分子功能中,连接和催化功能的靶基因最多。在富集通路方面,靶基因在核糖体的通路是高度富集的,而肿瘤通路富集的基因数目是最多的;在其他富集通路中,还存在很多与疾病调控相关的通路。
【基金】 国家自然科学基金项目(31272368);农业部公益性行业(农业)科研专项(201403064);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-22-syz17)
- 【会议录名称】 第十二届家（柞）蚕遗传育种暨良种繁育学术研讨会论文集（摘要汇编）
- 【会议名称】第十二届家（柞）蚕遗传育种暨良种繁育学术研讨会
- 【会议时间】2016-07-01
- 【会议地点】中国重庆
- 【分类号】S881.2
- 【主办单位】中国蚕学会、国家蚕桑产业技术体系