中国武汉人轮状病毒G3P[6],G4P[6]和G4P[8]的全基因组分析

【作者】 周璇； 刘满清； 王远虹； 汤伟峰； Ghosh Souvik； 庞蓓蓓； 彭劲松； 胡权； 周敦金； Nobumichi Kobayashi；

【机构】 中国湖北武汉武汉市疾病预防控制中心病毒科； 日本札幌札幌医科大学卫生系；

【摘要】 目的在中国武汉从散发的腹泻患者中检出2株G4P[6],1株G3P[6]和1株G4P[8]人轮状病毒(HRV)毒株,分别为RVA/Human-wt/CHN/E931/2008/G4P[6],RVA/Human-wt/CHN/R1954/2013/G4P[6],RVA/Human-wt/CHN/R946/2006/G3P[6]和RVA/Human-wt/CHN/E2484/2011/G4P[8]。对这些毒株的全基因组进行了测定,连同武汉同时期的人轮状病毒毒株一起进行系统发生分析,以推测每个RNA片段的来源。E931和R1954的基因型确定为G4-P[6]-I 1-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1,而R946和E2484的基因型分另别为G3-P[6]-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1和G4-P[8]-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1。系统发生分析表明E2484的全基因组(除VP7基因),R946的VP7基因,E931的NSP3基因属于人轮状病毒(HRVs)谱系。而4株的所有其它基因片段与中国猪轮状病毒(G4株的VP7基因,P[6]株的VP4、VP6、VP1和VP2基因,R1954的VP3基因,R946和R1954的NSP1和NSP3基因)或与来源于猪的人轮状病毒(E931和R946的VP3基因,E931的NSP1基因)密切相关,或在遗传上不同于典型的Wa基因组(P[6]株的NSP2、NSP4和NSP5基因)。因此,我们认为G4P[6]株R1954是直接传播到人的猪轮状病毒;G3P[6]株R946和G4P[6]株E931是具有单一人轮状病毒VP7基因和NSP3基因的猪轮状病毒与人轮状病毒的重配株;G4P[8]株E2484是具有猪轮状病毒VP7基因的人轮状病毒。尽管G4P[6]株E931和R1954和中国南方报道的那些G4P[6]人轮状病毒(例如GX54)有同样的基因型,它们的几个基因(VP2、VP3、NSP1-NSP4)与GX54属于不同的谱系。因此,这提示了猪轮状病毒中的各种重配株可能传播到人,随后与人轮状病毒发生随机重配。更多还原