基于线粒体Cytb全序列分析我国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传多样性

【作者】 赵习彬； 王保健； 简克灵； 廖晓霞； 杨光友； 赖为民； 古小彬；

【机构】 四川农业大学动物医学院；

【摘要】 (目的)为探讨我国绵羊痒螨(兔亚种)的种群遗传多样性。(方法)采集我国华北(河北HE1-8)、华东(山东SD1-7)、华中(河南HN1-5;湖北HB1-9)、西北(陕西SX1-8)和西南(四川SC1-31)5个地理种群的兔痒螨虫株68份,采用PCR扩增其线粒体细胞色素b(Cytb)全序列,采用生物信息学软件分析其种群遗传多样性。(结果)获得68条全长为1,100bp的Cytb全序列,共有46个单倍型;5个地理种群具有高单倍型多样性和核苷酸多样性(0,89286≤Hd≤1.000;0.00297≤Pi≤0.01256)的特点;分子变异分析(AMOVA)发现,主要变异来自种群内(83.15%);地理种群间存在较大的基因流(Nm=1.233944),中性检验结果不显著,但均为负值(Tajima’s D=﹣0.19657,P>0.05,Fu’s Fs=﹣1.95258,P>0.05),说明我国兔痒螨在较近的历史时期内出现过种群扩张现象;构建的NJ树和单倍型网络图均表明,各单倍型散布在不同的地理种群中,分布格局较为混杂,未形成明显的地理分布格局。(结论)5个地理种群的绵羊痒螨(兔亚种)遗传多样性较低,遗传分化不明显,还未形成显著的地理遗传结构。更多还原