ITS序列在橄榄地方品种资源鉴定中的应用

【作者】 杨培奎； 庄东红； 马瑞君；

【机构】 韩山师范学院生物系；

【摘要】 橄榄(Canarium album.L.),属于橄榄科(Burseraceae)橄榄属(Canarium),是我国南方的一种亚热带水果。在我国,橄榄有着悠久的栽种历史,主产区为广东省和福建省。在广东省橄榄主要种植于粤东地区,该地区存在着众多的橄榄品种资源,其中很多为农家品种,这些品种(系)间的亲缘关系繁杂,遗传背景混乱,因此亟待加快橄榄品种资源的鉴定。当前,橄榄品种的鉴定既有表型性状的鉴定也有分子标记技术的鉴定。由于表型性状易受外界环境条件的影响,而且往往受多个基因的影响,因此表型性状难以准确的反映品种间真实的基因差异。然而,分子技术则是直接基于DNA进行分析,有助于避免各种外界因素的影响,进行准确、快速的鉴定。已有研究采用RAPD、ISSR、SSR等分子标记技术对橄榄品种资源进行亲缘关系和遗传多样性分析。ITS作为核糖体转录间隔区受到的选择压力较小,具有较高的遗传变异,作为一种遗传标记被广泛地应用于被子植物系统发育以及植物DNA barcode和作物品种资源的研究,但目前未见其应用于橄榄资源研究的报道。为了探讨更精确有效地鉴定橄榄品种资源及其遗传多样性的分子技术,本研究利用测序方法对30份橄榄品种(系)的核糖体DNA中的内转录间隔区(ITS)序列(包括ITS1,5.8S和ITS2)进行了测定和序列比较分析。结果表明,橄榄ITS区序列总长度为629-634bp,长度变异仅为5bp,其中ITS1区为232-237bp,ITS2区为234-239bp,5.8SrDNA均为165bp,且高度保守无变异位点。橄榄品种(系)间ITS序列变异位点较少,仅有17变异位点占总碱基数的5.93%,简约信息位点7个占总碱基数1.51%,单一信息位点10个占总碱基数的2.16%,并且ITS1序列较ITS2序列变异丰富。因此,利用ITS序列中变异位点可以作为特异DNA指纹鉴定位点,为部分品种(系)的鉴定提供依据。更多还原