猕猴桃属33份核心雄性种质SSR指纹图谱构建及亲缘关系分析

【作者】 王斯妤； 钟敏； 廖光联； 陈璐； 黄春辉； 陶俊杰； 曲雪艳； 徐小彪；

【机构】 江西农业大学农学院/猕猴桃研究所；

【摘要】 通过对不同来源猕猴桃属(Actinidia Lindl.)33份核心雄性种质材料进行指纹图谱构建及遗传多样性分析,可为猕猴桃品种鉴定及选育工作奠定坚实的基础,也为今后规范进行知识产权的保护提供科学的理论依据。国际植物新品种保护联盟(UPOV,International Union forthe Protection ofNew Varieties ofPlants)拟定的分子测试指南中,将构建DNA指纹数据库的标记方法确定为SNP和SSR,其中SSR技术较成熟,已经成为当前各个作物建库的首选标记,且PCR产物稳定性好,重复性高。从猕猴桃SSR数据库中选取100对SSR引物,利用遗传背景差异大的4份猕猴桃雄性种质材料进行筛选,选出14对扩增条带清晰、具高多态性且重复性好的引物,对本研究供试的33份猕猴桃核心雄性材料进行扩增,利用1 0%聚丙烯酰胺凝胶对PCR扩增产物进行检测,采用非加权平均法(UPGMA)进行聚类分析。筛选得到的14对SSR引物共扩增出171条条带,其中含有163条多态性条带,占95.32%。最少可以通过5对高多态性SSR引物即能将33份猕猴桃雄性种质材料全部区分开。这5对SSR引物共扩增出83条条带,多态性条带82条,占98.80%,每个位点的等位基因为1~12个,平均每对引物为16.6个,发掘出猕猴桃雄性种质优异标记位点UDK96-035、UDK96-053、UDK96-040、Thr801、For13。以遗传相似系数0.69为界,所有供试材料聚为1类;以相似系数0.722为阈值,33份猕猴桃雄性种质可分为6个类群:1~11、14~25、30、31等25份中华猕猴桃雄性种质聚为一类,记为Ⅰ,亲缘关系较近,其中奉雄8号和奉雄9号以及山维4号和山维7号的相似系数最高,均达0.988,未测到山维5号和山维10号的条带差异;美雄4号、山维12号、奉雄12号各为一类,记为Ⅱ、Ⅳ、Ⅴ,与试验中其他材料的亲缘关系相对较低;美雄1号、美雄2号、山维13号聚为一类,记为Ⅲ,其中美雄1号和美雄2号的相似系数达0.988;山维14号和美雄3号聚为一类,记为Ⅵ。本试验基于SSR指纹图谱结果对猕猴桃属33份核心雄性种质进行遗传多样性分析,鉴定出‘中雄1号’和‘中雄2号’为同名异物,‘山维5号’和‘山维10号’为同物异名。更多还原