犬恶丝虫成虫转录组的研究

【作者】 付彦； 吴徐行； 谢跃； 兰景超； 张志和； 古小彬； 王淑贤； 杨光友；

【机构】 四川农业大学动物医学院； 成都大熊猫繁育研究基地；

【摘要】 背景犬恶丝虫可引起犬、猫的心肺犬恶丝虫病,同时还能感染多种野生哺乳动物以及人类。目前,对犬恶丝虫预防和治疗的根本策略的研究受限于缺乏对该病原体基本分子生物学特性的认识。方法和主要发现综合运用第二代测序平台、高效率的De novo短序列组装软件以及系统的生物信息学分析,我们揭示了犬恶丝虫成虫转录组的总体情况。经过去污染后我们得到了约2230万个干净的原始序列,并通过组装得到了20,810个unigene(平均长度为1,270 bp)。利用多种公共核酸/蛋白质序列数据库对unignene进行比对注释,共获得15,698个编码区(CDS),并且大约85%的unigene与数据库序列具有同源性。基于我们获得的犬恶丝虫转录组数据,我们提出了5个研究方向可供后续深入研究:有两类犬恶丝虫的转录本集合分别与免疫系统疾病以及心血管疾病有关联,而这两类转录本集合可能在寄生虫与宿主之间相互作用以及对宿主心脏的致病力方面有着重要作用。另外,我们通过广泛的比较转录组学研究发现了4,157个丝虫特有基因以及3,795个潜在的参与丝虫-沃尔巴克氏体共生关系的基因。最后,我们首次挖掘出了1101个犬恶丝虫肠道转录本集合,这为寻找"隐藏抗原"提供了帮助。结论及意义该研究大大扩充了现有的犬恶丝虫转录组数据量,并对其做了全新的阐释,为揭示该病原分子生物学特性以及逃避宿主免疫机制奠定了基础。同时,也为寻找犬恶丝虫新型疫苗候选基因和药物靶位点提供了平台。另外,转录组的研究还将为犬恶丝虫全基因组的注释提供帮助。更多还原