基于线粒体12S基因对青藏高原细粒棘球蚴种群遗传结构的研究

【作者】 延宁； 聂华明； 蒋忠荣； 邓世金； 余华； 严玉宝； 达瓦次仁； 孔维淑； 谢跃； 付彦； 杨德英； 古小彬； 杨光友；

【机构】 四川农业大学动物医学院； 四川省甘孜州畜牧科学研究所； 四川出入境检验检疫局； 西藏自治区动物疫病预防控制中心； 西藏那曲地区职业技术学校；

【摘要】 目的本研究旨在分析青藏高原细粒棘球蚴的种群遗传结构,为细粒棘球蚴病的防控提供基础资料。方法对采自青藏高原来自不同地区(青海、西藏、四川)不同宿主(人、绵羊、牛)的98株细粒棘球蚴进行了线粒体12S基因的全序列测序分析。结果 98个分离株鉴定为Echinococcus.granulosus sensu stricto(基因型G1-G3),其中包含15个核苷酸变异位点,共检测出13个单倍型(ES1~ES13),单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.381、0.00092。三个种群中,四川种群的核苷酸多样性最高(0.001353),种内遗传距离最大(0.00135)。分子变异分析(AMOVA)显示,种群内的遗传变异大于种群间的遗传变异。构建单倍型NJ树和贝叶斯树显示,ES10和ES11形成一个有别于其他单倍型的单倍型类群。单倍型网络显示,单倍型ES1是优势单倍型,其它单倍型围绕它成辐射状,未发现有地理聚类。基因流(Nm值)和遗传分化指数(FST值)显示各种群间未形成显著的遗传分化。结论青藏高原细粒棘球绦虫的基因型为G1-G3型;青藏高原细粒棘球绦虫种群内及种群间都存遗传多样性,其中四川种群的遗传变异性最大;青藏高原细粒棘球绦虫种群内变异是种群变异的主要来源;种群未形成地理聚类,遗传分化不明显。更多还原