小麦SNP整合图谱的构建和产量相关性状的QTL定位

【作者】 闻伟锷； 李法计； 高凤梅； 刘金栋； 金慧； 翟胜男； 何中虎； 夏先春；

【机构】 中国农业科学院作物科学研究所/国家小麦改良中心； 新疆农业大学农学院； 黑龙江农业科学院作物育种研究所； CIMMYT中国办事处；

【摘要】 本研究包括二部分:一是利用小麦90K SNP芯片扫描4个遗传群体:豆麦×石4185（F2:6）、藁城8901×周麦16(F_2:6)、临麦2号×中892(F_2:6)及周8425B×中国春(F_2:8)构建连锁图,并整合文献报道的5个SNP标记为基础的连锁图,构建高密度整合图;二是对除周8425B×中国春(F_2:8)以外的三个群体的籽粒性状、抽穗期、株高、旗叶、穗部性状等进行QTL定位。结果如下:（一）豆麦×石4185:图谱含有10,986个SNP标记,全长2159.93cM;藁城8901×周麦16:有11,819个SNP标记,全长3153.16cM;临麦2号×中892:有9824个SNP标记,全长2954.82cM;周8425B×中国春:有14,862个SNP标记,全长2302.94cM。四个图谱均覆盖21条染色体。将以上图谱和文献报道的5个图谱整合,有52,607个标记定位到21个连锁群上,覆盖21条染色体,全长3435.69cM。包括51,655个SNP标记,667个SSR标记,266个DArT标记以及19其它类型标记。（二）在豆麦×石4185群体中,检测到76个稳定QTL,解释表型变异的1.4%-71.5%;在藁城8901×周麦16群体中,检测到59个稳定的QTL,解释表型变异的3.1%-51.9%;在临麦2号×中892群体中,检测到61个稳定的QTL,解释表型变异的1.7%-54.2%。总计检测到16个新QTL,分别为:QGL.caas-7AS、QGW.caas-4AS、QGW.caas-6AL、QTGW.caas-2AS、QPH.caas-1BL、QPH.caas-2AL、QPH.caas-3AS、QPH.caas-5BL、QPH.caas-2BL、QPH.caas-6BL、QFLW.caas-4BS、QFLW.caas-5DL、QFLW.caas-6AS、QFLL.caas-6AS、QI-D.caas-1DL和QHD.caas-1BS。更多还原