利用小麦660K SNP芯片构建冰草遗传连锁图谱揭示了冰草与小麦染色体间的部分同源关系

【作者】 周升辉； 张锦鹏； 刘伟华； 鲁玉清； 杨欣明； 李秀全； 贾继增； 刘旭； 李立会；

【机构】 中国农业科学院作物科学研究所；

【摘要】 冰草（P基因组）是小麦族中的一个多年生近种,携带许多能够提高小麦遗传多样性的遗传变异和优异基因。确定冰草属与小麦染色体间的部分同源关系,能够促进由染色体间的同源配对和重组诱导的P基因组优异基因向小麦基因组中的转移。在此研究中,我们是用小麦660K SNP芯片对一个冰草属的F₁群体和31个小麦-冰草附加/代换系进行基因分型。构建了一个包含913个SNP标记,分布在7个连锁群,跨越了839.7 cM遗传距离的高密度遗传连锁图谱。标记间的平均遗传距离为1.8 cM。利用此图谱,我们确定了P基因组与小麦染色体间的部分同源关系,揭示了P和小麦基因组间共线性良好且相对保守。但是,与小麦基因组相比,一些明显的染色体重组和渗入遍布了整个P基因组。使用此图谱和基因分型数据,我们确定了31个小麦-冰草附加/代换系的染色体组成和附加的P染色体,涉及了所有7个P染色体的渗入。在此研究中,利用高密度的遗传连锁图谱对P基因组与小麦染色体间部分同源关系的确定和31个小麦-冰草附加/代换系的解析能够加速冰草遗传变异向小麦基因组中的转移,促进小麦的遗传改良。更多还原