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利用RNA-Seq进行大豆杂交种花苞的转录组比较分析
Comparative Transcriptome Analysis of Flower Heterosis in Two Soybean Hybrids by RNA-seq
【作者】 张春宝; 林春晶; 彭宝; 闫昊; 张井勇; 张伟龙; 王鹏年; 丁孝羊; 张伟; 赵丽梅;
【Author】 ZHANG Chun-bao;LIN Chun-jing;PENG Bao;YAN Hao;ZHANG Jing-yong;ZHANG Wei-long;WANG Peng-nian;DING Xiao-yang;ZHANG Wei;ZHAO Li-mei;Soybean Research Institute/National Engineering Research Center for Soybean,Jilin Academy of Agricultural Sciences;
【机构】 大豆研究所/大豆国家工程研究中心吉林省农业科学院;
【摘要】 杂种优势作为增加作物产量的一种有效方法己被广泛应用。然而,其潜在的分子遗传机制仍不清楚。本研究利用RNA-seq分析了两个大豆杂交种"杂交豆1号"和"杂交豆5号"及其亲本的花转录组,产生了3.38亿个高质量reads,共鉴定出68l和899个基因在杂交豆1号和5号及其亲本之间存在表达差异。这些差异表达基因(DEGs)被划分为具有12种表达模式的四种主要表达类型。此外,GO分析表明,DEGs在代谢过程和催化活性方面非常丰富,而KEGG分析发现,代谢途径和次生代谢物的生物合成在两个杂交种中富集。通过GO和KEGG分析比较两个杂交种的DEGs,鉴定出26个表达显著上调的DEGs,这些基因被认为是大豆杂种优势的潜在候选基因。本研究获得了大量的杂交种和亲本的花转录组数据,并进行了初步分析,这为大豆杂交育种提供了有用的信息,也将为大豆杂种优势分子机理研究奠定理论基础。
- 【会议录名称】 第十届全国大豆学术讨论会论文摘要集
- 【会议名称】第十届全国大豆学术讨论会
- 【会议时间】2017-07-31
- 【会议地点】中国北京
- 【分类号】S565.1
- 【主办单位】中国作物学会大豆专业委员会