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基于生物信息学的大豆脂肪酸组分含量的QTLs定位

Comparative QTL mapping of fatty acid component content in soybean based on biomformatics

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【作者】 秦洪涛齐照明辛大伟陈庆山

【Author】 QIN Hong-tao;QI Zhao-ming;XIN Da-wei;CHEN Qing-shan;College of Agrivulture,Northeast Agricultural University;

【机构】 东北农业大学农学院

【摘要】 大豆种子脂肪酸组分含量在食品、动物饲料和一些工业应用中得到高度重视,植物育种者不断提高种子脂肪酸成分价值。通过开发数量性状基因座(QTL)可以促进大豆种子脂肪酸含量的增加。本研究中,利用来自soybase数据库和文献报道的163个与大豆脂肪酸含量相关的原始QTL信息,采用软件BioMercator2.1进行元分析,得到43个大豆脂肪酸含量的"通用"QTL,分别位于大豆的2号、3号、5号、6号、8号、9号、10号、11号、13号、14号、15号、16号、17号、18号、19号和20号染色体。同时,利用基于统计学原理的Overview方法进行优化,鉴定37个与Meta分析相近的"通用"QTL置信区间,将这些QTL位点的置信区间最小缩至0.5cM:,并且定位到确定的染色体上。经过Overview分析后共9个"通用"QTL置信区间距离大于Meta分析得到的"通用"QTL置信区间距离,分别是5号、15号和20号染色体第一个"通用"QTL,2号、11号和17号染色体第二个"通用"QTL,11号和19号染色体第三个"通用"QTL,13号染色体第四个"通用"QTL,其余28个"通用"QTL置信区间距离均小于Meta分析得到的"通用"QTL置信区间距离。此外,对位于这些"通用"QTL置信区间的所有基因功能进行预测,并鉴定与脂肪酸合成代谢途径相关的16个候选基因。本研究结果将为大豆脂肪酸含量相关QTL位点的精细定位及分子标记辅助育种奠定基础。

  • 【会议录名称】 第十届全国大豆学术讨论会论文摘要集
  • 【会议名称】第十届全国大豆学术讨论会
  • 【会议时间】2017-07-31
  • 【会议地点】中国北京
  • 【分类号】S565.1
  • 【主办单位】中国作物学会大豆专业委员会
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