高通量基因测序在胎儿性染色体非整倍体产前检测中的应用价值

【作者】 郑芳秀； 周琴； 陈英苹； 张晓青； 虞斌； 袁珮；

【机构】 常州市妇幼保健院；

【摘要】 目的:近年来,随着分子生物学的飞速发展,高通量基因测序、又称无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)已广泛应用于胎儿染色体非整倍体异常的产前检查,其对T21、T18和T13检测的准确率分别高达99.4%、97.4%和92.5%,假阳性率分别为0.2%、0.5%和0.8%[2]。然而,该技术在性染色体异常产前检测的研究较少。本研究主要探讨高通量基因测序用于胎儿性染色体非整倍体检测的可行性。方法:2012年5月至2015年5月,在常州市妇幼保健院产前诊断中心就诊、经知情同意自愿选择NIPT的3218例单胎孕妇,孕龄15~26周,年龄16~49岁。抽取孕妇外周血,提取血浆中胎儿游离DNA,制备文库,采用Illumina NextSeq CN500测序平台对其进行高通量测序,经生物信息学分析提示性染色体异常患者行羊膜腔穿刺,羊水细胞培养后染色体G显带核型分析。对测序结果和羊水细胞遗传学结果比对分析。结果:3218例样本中,NIPT提示共有16例性染色体非整倍体异常,包括9例45,X,3例47,XXX,4例47,XXY。经产前遗传咨询,12例孕妇自愿接受羊膜腔穿刺术,经羊水细胞培养G显带染色体核型分析,发现8例核型结果与NIPT结果一致,包括3例45,X,3例47,XXX,2例47,XXY。4例样本出现NIPT假阳性,NIPT提示3例45,X和1例47,XXY,而羊水染色体核型分析均为正常核型。虽经充分产前咨询,仍有3例孕妇(2例45,X和1例47,XXY)拒绝羊膜腔穿刺,另1例孕妇(45,X)因胎儿B超示颈部水囊瘤予引产。经NIPT筛查后羊水细胞核型分析确诊8例性染色体非整倍体异常孕妇,发生率为0.25%(8/3218),应用高通量基因测序技术检测性染色体非整倍体异常的阳性预测值为66.6%(8/12)。同时,本次研究12例NIPT提示异常孕妇中,4例经羊水确诊为假阳性。结论:应用NIPT检测性染色体非整倍体异常有一定效果,其阳性预测值为66.67%(8/12),其检测的准确性仍有待进一步提高。高通量测序作为无创产前诊断技术对性染色体三体检测的准确率高于性染色体单体。即有必要加大该技术的规范应用,同时也会加强临床应用的研究,以得出更科学的临床数据。更多还原