miRNA单核苷酸多态性与肺癌易感性的关联研究

【作者】 秦娜； 王铖； 朱猛； 沈伟； 程阳； 戴俊程； 马红霞； 靳光付； 胡志斌； 沈洪兵；

【机构】 南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系；

【摘要】 目的肺癌是全球最常见的恶性肿瘤之一,死亡率约占全球所有癌症死亡人数的1/3。流行病学研究显示,肺癌的发生是遗传因素和环境因素共同作用的结果。单核苷酸多态性位点（SNP）是最常见的遗传变异,可以影响基因的表达、转录和翻译,是导致疾病易感性的重要原因之一。MicroRNA（miRNA）是约22个核苷酸长度的非编码小分子RNA,通过与靶信使RNA 3’非翻译区结合负性调节其转录与表达,使其翻译抑制和降解,在很多疾病的发生发展过程中有重要作用。多项研究表明miRNA在肺癌患者和正常对照中存在表达差异,而一些miRNA上的SNPs可以影响miRNA的表达或功能,进而影响疾病的发生。本文旨在系统研究miRNA谱系相关SNPs是否与肺癌的易感性有关,初步探讨其SNP对肺癌的发生有无影响,为肺癌易感性的研究提供新的理论依据。方法首先通过公共数据库miRbase和文献检索查找所有miRNA,采用大样本病例对照研究设计,对中国人群中2,331名肺癌病例和3,077名对照进行miRNA相关SNPs的分析。基于Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0获得基因分型数据,并用PLINK1.07软件对原始基因分型数据进行系统的质量控制,剔除在中国人群中MAF<0.05以及Hardy-Weinberg平衡定律P<1.0×10^-5的位点。采用logistic回归模型计算SNPs的关联P值、关联强度比值比（odds ratio,OR）值以及95%可信区间（confidence interval,CI）。满足以下要求的位点进入二阶段验证:（1）病例（2,331例）与对照（3,077例）关联P值P≤0.01;（2）满足上述标准的位点中具有高连锁不平衡（r²>0.8）的位点,则纳入P值最低的位点。最终对二阶段验证满足P<0.05的位点进行分析,以期发现肺癌特异的miRNA相关的遗传易感区域。二阶段验证样本为欧洲人群（1,937名病例和1,984名对照）。结果在检索公共数据库及文献后一共查询到1871个miRNAs,质量控制后有293个SNPs位于这些miRNA上,其中满足初筛标准P≤0.01的位点一共有15个。进一步在欧洲人群中进行验证,发现hsa-mir-4459 rs73112689（T>C）达到验证标准,P值为0.005。多因素分析的结果表明,与携带TT野生纯合基因型的个体相比,携带TC杂合基因型者和CC突变纯合基因型者患肺癌的风险分别显著降低18%（校正后OR=0.82,95%CI=0.71-0.95,P=0.009）和26%（校正后OR=0.74,95%CI=0.55-0.99,P=0.040）。同时,在显性模型和相加模型中,hsa-mir-4459rs73112689与肺癌的发生风险均显著相关（显性模型:校正后OR=0.80,95%CI=0.69-0.93,P=0.003;相加模型:校正后OR=0.80,95%CI=0.70-0.92,P=0.001）。结论位于hsa-mir-4459上的SNP rs73112689可能影响肺癌的易感性。更多还原