中草药重要成分的QSAR预测毒性数据库的建立

【作者】 高雅； 姚碧云； 周宗灿；

【机构】 北京大学医学部公共卫生学院毒理系；

【摘要】 【研究背景】中草药成分研究是开发新药的前提,是研究中草药药效和毒作用的基础。由于长期受中草药毒作用小的观念影响,中草药的毒性研究一直是一个比较薄弱的环节。随着对中草药需求和应用的日益广泛,临床中草药不良反应的发生率逐渐增加,中草药的毒性越来越受到人们重视。但是有关中草药成分的毒性资料却很缺乏,因此使用一种可以快速预测中草药成分毒性的方法尤为重要。本研究将对中草药成分的毒性预测方法进行探索,以促进中草药的毒性识别和中药现代化。【方法】本研究从中医药院校本科生教材《中药化学》和北京大学药学院六年制教材《天然药物化学》二书中选取了984个中草药重要成分,用以建立中草药重要成分的QSAR预测毒性数据库。本数据库分为4个子库:基本化学信息子库、化学结构式图子库、毒性实验数据子库和毒性QSAR预测数据子库。基本化学信息子库和化学结构式图子库的内容通过Toxnet、PubChem、SciFinder和ACS等网站查询获得。中草药成分的毒性实验数据主要来源于Toxnet、PubMed等数据库以及国内数据库。中草药成分的毒性预测数据通过多种公开和商业的QSAR预测软件如T.E.S.T、Toxtree、QSAR Too1box、TOPKAT、Derek获得。本研究将延用遗传毒理学试验预测致癌物结果的评价方法,利用贝叶斯逆概率定理,采用灵敏性、特异性、准确性、Kappa值等主要指标对中草药成分的毒性QSAR预测进行可靠性评价。【结果】本研究建立了中草药重要成分的QSAR预测毒性数据库。在4个子库中,基本化学信息子库中中草药成分的基本信息包括各中草药成分的英文名称、中文名称、CAS、SMILES编码、分子式、化学分类。化学结构式图子库中为mol格式的化学结构图。毒性实验数据子库和毒性QSAR预测数据子库的毒性终点括经口急性毒性、慢性毒性、致癌性(遗传毒性和非遗传毒性)、致突变性(Ames试验和骨髓微核试验)、发育毒性及毒理学关注阈值TTC。【结论】本研究通过对中草药成分的毒性预测方法进行探索,可为中草药成分的毒性资料提供有价值的参考。更多还原