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烟草橙蛋白基因的克隆与生物信息学分析
【作者】 雷波； 卢坤； 丁福章； 刘小容； 胡重怡； 潘文杰；
【机构】 西南大学农学与生物科技学院； 贵州省烟草科学研究所；
【摘要】 项目组前期的烟叶基因芯片检测结果表明,类胡萝卜素合成途径的橙蛋白(Orange protein,OR)基因在中间香型与清香型烟叶中呈显著差异表达。为了获得烟草OR(Nt OR)基因的全长序列和进一步揭示其在烟叶特色形成中的作用,采用同源克隆法从烟草品种K326中克隆了Nt OR的全长c DNA和基因组DNA序列,Gen Bank登录号为JN379458和JN375578。生物信息学分析表明,Nt OR基因组DNA全长5027 bp,c DNA为1188 bp,编码317个氨基酸残基。Nt OR蛋白具有2个跨膜域、1个信号肽剪切位点、5个糖基化位点和11个磷酸激酶修饰位点,二级结构包含12个α-螺旋和20个β-折叠,亚细胞定位于质膜上。系统进化与BLAST分析表明Nt OR是Sl OR和Vi OR的垂直同源基因。GENEVESTIGATOR数据库的芯片结果显示,Nt OR基因在子叶中的表达量最高,其次是成熟叶片,幼茎和花,其他组织器官的表达相对较弱。
【基金】 贵州省科学技术基金项目(黔科合J字[2010]2088号);贵州省烟草专卖局(公司)项目(黔烟科2010-02)“贵州省不同风格特色烟叶形成的分子机制研究”,贵州省烟草专卖局(公司)项目(黔烟科2010-12)烟草类胡萝卜素致香前体物质合成途径关键酶基因克隆及表达研究”
- 【会议录名称】 中国烟草学会2012年学术年会论文集
- 【会议名称】中国烟草学会2012年学术年会
- 【会议时间】2012-09-11
- 【会议地点】中国江苏南京
- 【分类号】S572
- 【主办单位】中国烟草学会