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海南辣椒上potyviruses的株系多样性分析
【作者】 梁洁； 王健华； 余乃通； 张真； 周启林； 刘志昕；
【机构】 中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物技术重点开放实验室；
【摘要】 为澄清侵染海南辣椒的马铃薯Y病毒属病毒的株系和亲缘关系,我们克隆了多个辣椒样品上的ChiRSV、PVMV和ChiVMV 3种potyviruses的CP基因,进行了序列多态性分析。以CP基因为基础,结合GenBank中已登录的各病毒CP基因序列,运用最大似然法,构建各病毒的系统进化树。结果表明:ChiVMV各分离物能分成4组,分别命名为Group 1、Group 2、Group 3和Group 4,ChiVMV海南分离物之间的CP基因序列一致性大于98%,是一个株系,且属于其中的ChiVMV Group 1株系;根据系统进化树,ChiRSV海南分离物的CP基因分成两个有差异的簇,各簇内的ChiRSV CP基因序列一致性高,但簇与簇的分离物之间的CP基因序列与CP氨基酸序列一致性分别为91.6%~100%,92.9%~100%,因此海南辣椒上存在两个ChiRSV株系,暂命为ChiRSVⅠ组与ChiRSVⅡ组;PVMV海南分离物CP基因序列一致性大于98%,聚为一簇,属于一个PVMV株系,暂命为PVMV亚洲组。
【关键词】 辣椒；
Potyviruses；
CP基因；
多样性分析；
【基金】 海南省重点科技计划应用研究及产业化项目(No.ZDXM20130046);海南省自然科学基金项目(No.313076);海南省创新引用集成专项(No.KJHZ2014-01)
- 【会议录名称】 病虫害绿色防控与农产品质量安全——中国植物保护学会2015年学术年会论文集
- 【会议名称】中国植物保护学会2015年学术年会
- 【会议时间】2015-09-09
- 【会议地点】中国吉林长春
- 【分类号】S436.418
- 【主办单位】中国植物保护学会