与草菇低温自溶相关的功能基因发掘及验证

【作者】 龚明； 鲍大鹏； 汪虹； 陈明杰； 谭琦；

【机构】 上海市农业科学院食用菌研究所；

【摘要】 草菇(Volvariella volvacea)属于高温菇类,不耐低温冷藏,在常规低温4℃下,菌丝就会迅速自溶,子实体会软化、液化甚至腐烂。在对冷处理下的草菇菌丝进行高通量测序之后,我们识别了20个显著上调的基因,进而对15个注释的基因进行功能注释簇分析,获得了FBDC(cyclin-like F-box domain)和UBE2(ubiquitin-conjugating enzyme E2)两个功能注释簇。我们已通过研究发现了一条FBDC基因(FBDV1)参与了低温自溶(Gong et al.,2015)。本研究结合冷诱导处理草菇菌丝的表达谱分析,在24个UBE2基因中又识别出一条显著上调的UBE2基因(UBEV2)。实时定量PCR分析证实了草菇冷处理4h,6h和8h后UBEV2的表达显著上调(P<0.05)。UBEV2在近来分化的草腐菌特异的分布提示了UBEV2并不是通过连续演化而来。通过UBEV2的同源序列构建系统发生树,提示了UBEV2是通过水平基因转移而来。进一步的自然选择检测显示UBEV2的演化具有正向选择特征。相对时间估计显示了该事件为近来发生的。分子模拟和logo分析显示了cysteine-cysteine motif为UBEV2家族的特征标记,提示了UBEV2家族为新发现的UBE2家族。这些结果提示UBEV2是一条与草菇低温自溶相关的新类型的UBE2。更多还原