【作者】 王星星； 刘方； 周忠丽； 蔡小彦； 王坤波；

【机构】 中国农业科学院棉花研究所；

【摘要】 本研究在300 mmol·L^-1盐胁迫处理3 h后对4个不同棉种（G.hirsutum TM-1、G.hirsutumrace mariegalante 85、G.babadense 3-79和G.tomentosum）的叶和根取样并进行转录组测序。通过对每个棉种处理和对照根和叶的转录组数据进行比较分析,发现根部响应盐胁迫的基因数量远远大于叶片（TM-1:3474-1730,mariegalante 85:3977-1356,3-79:1694-1453,G.tomentosum:1791-852）;通过对不同种间差异表达基因的种类及数量进行比较,发现陆地棉及陆地棉野生种系受（半野生棉）盐胁迫影响的基因远多于海岛棉和毛棉;结合利用水培对4个不同棉种抗盐能力的鉴定结果:毛棉>3-79>玛丽加朗特85>TM-1,推测相较于陆地棉及半野生棉,毛棉和海岛棉本身具有较强的耐盐性,当遇到高浓度盐胁迫时只需要调动少量的资源来应对。为了能够从几千个响应盐胁迫的基因中挑选出真正与耐盐显著相关的基因进行后续研究,作者筛选出棉种间的直系同源基因的转录本。通过对棉种间的直系同源基因的转录本进行序列多样性分析,对这些基因在棉种驯化过程中受到的选择作用模式进行分析,得到7个受到强烈正向选择的差异表达基因,通过对这7个基因进行注释分析,发现均与植物响应非生物胁迫相关,表明这些基因在驯化过程中对棉花的环境适应性具有重要作用。更多还原