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棉花叶绿体基因组全序列微卫星分布规律研究
Distribution of Microsatellite from Complete Sequence of Gossypium hirsutum Chloroplat DNA
【作者】 蔡小彦; 刘方; 周忠丽; 王星星; 王春英; 王玉红; 王坤波;
【机构】 棉花生物学国家重点实验室/中国农业科学院棉花研究所;
【摘要】 利用已公布的陆地棉(Gossypium horsutum)叶绿体基因组全序列测序结果,应用生物信息学软件对其叶绿体微卫星(cpSSR)的分布规律进行了全面分析。结果发现,陆地棉叶绿体基因组上共有72个微卫星,主要分布于大单拷贝区和小单拷贝区,且以单碱基微卫星为主,占总数的76.4%;二碱基微卫星占总数的20.8%;三碱基微卫星占总数的2.8%。在单碱基微卫星中,又以A/T重复为主,二者共占单碱基微卫星的92.7%。单碱基微卫星的重复次数以10~12次为主,二碱基微卫星的重复次数以5~6次为主。本研究结果为开发棉属植物叶绿体通用引物提供了理论依据。
- 【会议录名称】 中国棉花学会2015年年会论文汇编
- 【会议名称】中国棉花学会2015年年会
- 【会议时间】2015-08-10
- 【会议地点】中国新疆维吾尔自治区昌吉
- 【分类号】S562
- 【主办单位】中国棉花学会