冬瓜果皮颜色基因的定位

【作者】 刘文睿； 谢大森； 江彪； 彭庆务； 林毓娥； 梁肇均；

【机构】 广东省农业科学院蔬菜研究所； 广东省蔬菜新技术研究重点试验室；

【摘要】 果皮颜色是影响瓜类蔬菜商品和感官价值的最重要性状之一,对冬瓜品种选育具有重要意义。本研究中以墨绿色果皮材料与黄色果皮材料为亲本构建的F2群体,利用基于冬瓜转录组测序而开发的冬瓜特异SSR标记和SRAP标记,构建冬瓜遗传图谱,并定位控制冬瓜果皮颜色基因。以冬瓜黄色果皮材料B214为母本,墨绿色果皮材料B227为父本进行杂交获得F₁代,F₁自交获得F2代。2011年春季将亲本、F₁及F₂播种于广东省农业科学院白云实验基地,单株种植,完全随机排列,在果实完全成熟后调查果皮颜色。结果显示,母本全部为黄色果皮,父本及F₁全部为墨绿色果皮,F2群体的120个单株中墨绿色果皮87株,黄色果皮33株,符合3:1的分离比例,说明冬瓜果皮颜色性状由单基因控制,绿皮对黄皮为显性（父本显性）。采集亲本及F2各单株的嫩叶,用CTAB法提取基因组DNA。利用基于转录组测序而开发的冬瓜特异SSR标记及SRAP标记首次构建冬瓜遗传图谱。将1150对SSR引物及2 478对SRAP引物组合在亲本间进行扩增。获得多态性SSR引物29对,每对引物均扩增出一个多态性位点。其中共显性位点27个,显性位点2个（均表现为父本显性）。获得多态性SRAP引物112对,其中1对引物扩增出3个多态性位点,21对引物扩增出2个多态性位点,其余均为1个多态性位点。共显性位点5个,显性位点158个（母本显性51个,父本显性107个）。将141对多态性引物所产生的163个位点在F2群体单株中进行扩增验证,经卡平方检测,有6个SSR标记和23个SRAP发生偏分离,偏分离率17.8%。将163个分子标记数据,通过Join-map 4.0软件进行图谱构建,获得了包含16个连锁群,100个标记（SSR标记17个,SRAP标记82个,性状标记1个）的冬瓜遗传连锁图谱。图谱总长790 cM,标记平均间距7.9 cM。在29个偏分离标记中,11个定位在图谱的7个连锁群上。将果皮颜色性状按父本显性的条带统计方法进行统计,与母本性状（黄色果皮）相同的F2单株记为A,与父本性状（墨绿色果皮）相同的记为C。利用Join-map 4.0软件计算连锁关系及遗传距离,最终将控制墨绿色果皮颜色基因定位在LG4连锁群,获得一个与其连锁的SRAP标记M14OD24,连锁距离为4.5 cM。果皮颜色是冬瓜重要的外观品质性状,只能在果实成熟后才可调查。本研究中通过冬瓜遗传图谱的构建对果皮颜色基因进行了初步定位,将为苗期辅助选择奠定基础,加快品种选育进程。更多还原