基于SRAP和IRAP标记的一个野生君迁子居群取样策略分析

【作者】 张平贤； 汤红； 王燕； 胡梦珏； 张青林； 罗正荣； 郭大勇；

【机构】 华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室； 大别山特色资源开发湖北省协同创新中心；

【摘要】 君迁子(Diospyros lotus L.)是柿(D.kakiThunb.)的主要砧木,适应性和繁殖能力强,种内变异和分布范围广,与‘富有’系完全甜柿品种嫁接亲和性表现复杂,有关君迁子遗传多样性和居群取样策略尚不完全清楚。以大别山东部的安徽省金寨县(海拔600~710 m)分布的40份野生君迁子居群单株和华中农业大学柿圃(海拔30 m)活体保存的7份柿品种及1份浙江柿(D.glaucifolia L.)种质为试材,基于SRAP和IRAP分析其居群取样策略;利用POPGENE1.32分析其观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(N_e)、Nei’s基因多样性指数(H)、Shannon’s信息指数(I)和多态性百分比(PPL),采用Excel 2010统计分析。主要研究结果:(1)20对SRAP引物扩增出188条谱带,多态性比例为94.68%,有效多重系数为3.71,多态性信息含量为0.31;(2)9条IRAP引物共扩增出102条带,多态性比率为95.10%,有效多重系数为2.02,多态性信息含量为0.27;(3)整合SRAP和IRAP数据,多态性比率为94.83%,有效多重系数为5.73,多态性信息含量为0.30;(4)UPGMA和PCoA聚类分析将供试君迁子居群与柿和浙江柿分开,‘松本早生’、‘上西早生’与‘富有’,以及‘次郎’与‘前川次郎’聚类成组;(5)供试君迁子居群的多态性比例为87.36%,观测等位基因数为1.8736±0.3329,有效等位基因数为1.5379±0.3525,Nei’s基因多样性指数为0.3105±0.1750,Shannon’s信息指数为0.4614±0.2371;(6)7个抽样梯度(依次为5、10、15、20、25、30、35)各重复10次抽样,Nei’s基因多样性指数在取样梯度为20时达到总体的96.23%,Shannon’s信息指数和多态性百分比在取样梯度为25时分别达到总体的96.75%和95.32%。更多还原