大肠癌差异表达基因的筛查

【作者】 许红民； 王强； 白雪娟； 钟定荣； 曹秀堂； 张金萍； 丁彦青； 姚开泰；

【机构】 第一军医大学病理解剖教研室肿瘤研究所； 解放军总医院第309临床部； 解放军总医院病理科； 解放军总医院医疗质量管理研究所；

【摘要】 目的筛查人大肠癌组织与相应正常大肠粘膜差异表达基因,为寻找大肠癌分子标记物和从整体上探讨大肠癌发生的分子机制奠定基础。方法应用美国affymetrix HG-U133寡核苷酸芯片(代表迄今所知的32264个人类全基因,包括19308个已知的人类基因和12956个EST簇)检测9例大肠癌组织及相应正常大肠粘膜基因表达谱,并以实时荧光定量PCR技术对基因芯片检测结果进行验证:综合运用交集补集、秩和检验及T检验比较两组表达谱数据。结果获得大肠癌组织与正常大肠粘膜组织差异表达基因和:ESTs3125个(包括肿瘤上调基因&ESTs974个、下调基因&ESTs2151个);大肠癌组织表达而相应正常粘膜不表达的基因&ESTs245个:大肠癌组织不表达而正常粘膜表达的基因&EsTs162个;最重要的人肠癌差异表达基因&ESTs17个。本研究所筛得之大肠癌差异表达基因80.1%未见报道。结论综合运用补集分析、T检验、秩和检验对基因谱数据进行挖掘的策略,是可行和有效的。更多还原