EB病毒感染的低分化鼻咽鳞状细胞基因表达谱

【作者】 方唯意； 刘腾飞； 谢卫兵； 王爽； 杨旭宇； 任彩萍； 丁彦青； 姚开泰；

【机构】 中南大学湘雅医学院肿瘤研究所； 南方医科大学肿瘤研究所；

【摘要】 鼻咽癌的发病机制涉及到多基因的协同参与。鼻咽部相对狭小,当该部位发生癌变时,肿瘤细胞生长受限,肿瘤标本一般很小。而对侧正常的标本更是难以获取,实际上,鼻咽癌的基因差异表达谱研究很少。本研究试图通过8000点的人类基因芯片进一步研究鼻咽癌基阅差异表达谱,希望找到鼻咽癌发病过程中一些重要的基因。首先102例标本进行严格冰冻切片和PCR EB病毒筛选后,将符合要求的32例癌细胞在70%以上的鼻咽低分化鳞状细胞癌组织随机分为8组,每组4例,由Cy3标记,24例来自于鼻咽癌病人的正常或慢性炎症鼻咽粘膜混合一起,作为对照,Cy5标记,建立鼻咽癌组织与正常组织之间的差异表达谱,分别找出各自差异表达谱中有2倍以上的差异表达基因和ESTs。结果发现,在至少7个实验组织样品结果中发生了显著性表达变化作为代表性的病理相关基因,按照这一标准共有647个基因在至少7个实验/对照组织间发生了显著性表达变化,其中发生上调表达变化的基因有298个,发生下调表达变化的基因有315个。将这些共同的差异表达基因进行生物信息学分析,发现这些基因主要涉及细胞免疫、信号转导功能、代谢、细胞生长、细胞周期、细胞运动,细胞凋亡和粘附等多个功能。差异表达基因进一步MILANO分析,寻找与这些基因相关的鼻咽癌和其他肿瘤文献,这为我们分析高通量基因芯片数据提供了一个良好的平台。更多还原