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TGGE法分析东湖浮游病毒遗传多样性

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【作者】 裴达程凯赵以军

【机构】 华中师范大学生命科学学院,城市水环境生态学重点实验室

【摘要】 在一年(2004年8月-2005年7月)的时间内对武汉东湖的六个湖区(水果湖、郭郑湖1号点、郭郑湖2号点、后湖、牛巢湖和汤菱湖)的浮游病毒的遗传多样性进行了调查研究。将采集的水样经过过滤、超离处理之后,分别选择了编码T4噬菌体主要衣壳蛋白的GP23基因以及编码T7类噬菌体DNA聚合酶基因设计引物进行PCR扩增,其中根据GP23基因设计的引物和病毒DNA模板能够成功扩增出一段长约500bp的序列。接着,通过温度梯度凝胶电泳(temperature gradient gel electrophoresis,TGGE)对阳性的PCR产物进行了进一步的分析,发现至少可以区分出3个泳带。上述研究结果不但说明采用PCR-DGE技术进行浮游病毒的遗传多样性研究是完全可行的,而且也初步证明浮游病毒遗传多样性的能够发生规律性的变化。

【关键词】 东湖浮游病毒TGGE遗传多样性
  • 【会议录名称】 第二届中国青年学者微生物遗传学学术研讨会论文集
  • 【会议名称】第二届中国青年学者微生物遗传学学术研讨会
  • 【会议时间】2006-10
  • 【会议地点】中国湖北武汉
  • 【分类号】Q939.4
  • 【主办单位】中国遗传学会微生物遗传学专业委员会
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